脑肿瘤的大小、位置以及血供等情况的复杂性，使得脑肿瘤切除的手术也存在相当的复杂性，多数的脑肿瘤能够通过一次手术切除，但是也有少数复杂的脑肿瘤需要多次手术才能够达到比较满意的切除。
脑部的肿瘤由于位于颅腔内，使得手术到达脑部的肿瘤需要首先越过颅骨的阻挡，手术暴露的范围有一定限制。有的情况是脑内存在多个脑肿瘤，而且分布在不同的部位，一次开颅手术只能切除一个或者其邻近部位的肿瘤，需要分次手术才能够将脑内的多个肿瘤切除。也有的情况是虽然只有一个肿瘤，但是肿瘤的范围比较大，涉及到多个部位，通过单一的骨瓣或者入路难以切除，需要分次手术采用另外的入路和骨瓣来切除。虽然一次手术也可能采用多个骨瓣和入路来切除脑内的多个肿瘤或者范围比较大的肿瘤，但是手术创伤和风险都比较大，通过分次手术则能减少手术创伤减低手术风险。
也有的肿瘤是血供非常丰富，直接开颅手术切除有大出血或者出血难以控制的风险，需要采用介入的方法先栓塞也就是堵塞一部分血供，减少肿瘤的供血，这样就能减少开颅手术过程中出血量，降低手术中大量出血带来的风险和创伤。
一般脑肿瘤手术都是力争一次开颅将肿瘤彻底切除，但是对于比较复杂的脑肿瘤，有时需要有计划的多次手术来切除肿瘤。广州中山大学肿瘤防治中心神经外科柯超主诊教授指出，复杂脑肿瘤的开颅切除需要根据肿瘤的部位数量等制定个体化的手术方案，在少数特殊情况下，分次切除脑部的肿瘤是较少手术风险和创伤的可选择的方案之一。